Суть конфликта между синодалом Соболевым и русскими софиологами можно показать на примере отношения ко Второй Ипостаси Троицы. В своё время, когда Церковь только прорастала в понимание троического бытия Бога и в тайну воплощения Мессии, одни утверждали, что Исус Христос не является Сыном Божиим, т.к. нетварный Бог не может воплотиться (арианская ересь). Другие наоборот выводили Творение непосредственно из нетварной сущности Творца и не видели в этом особой проблемы (ересь пантеизма).
Аналогичным образом софиологи, пытаясь сохранить переходное звено между человеческим тварным умом и нетварным умом Бога, несколько неуклюже привязывали природу Софии к Творению. Тем самым терялась её связь с нетварной Премудростью Сына. В противовес этому синодальные модернисты вообще отрезали Софию от плотского ума человека. Т.е. поступили в прямом смысле, как антихристы: «…всякий дух, который не исповедует Исуса Христа, пришедшего во плоти, не есть от Бога, но это дух антихриста, о котором вы слышали, что он придет и теперь есть уже в мире» (Ин. 4:3).
Вот в чем суть этой чрезвычайно запутанной истории. Поэтому всякий, кто не исповедует Премудрость Божию, воплощаемую в плотский ум человека через Софию Божию, находится в плену духов заблуждения. Говоря еще проще, если человек посредством биологического мозга способен думать о вещах Божественных, коим нет места в Творении, то Связь безусловно существует. И отвергающие существование этого переходного Звена отвергают само духовное мышление как таковое. Поэтому они теряют ключ к пониманию простейших вещей духовной реальности.
В споре Соболева и Булгакова нельзя отдать кому-либо предпочтение. Суть вопроса ни одна из сторон так и не раскрыла. Одни пытались вырвать богомыслие из склепа официальной системы, другие, опираясь на административный ресурс, стремились задушить ростки живого подхода к познанию божественных тайн. Толком ни у кого ничего не вышло и вопрос остался открытым.
Таким образом, как Пресвятая Троица есть Бог единый, но в трех Лицах, так и Премудрость есть единая Премудрость Бога, но проявляемая в четырех образах бытия: как Молчание, как Логос, как София и как Человек. София — это утроба, стены храма, в которые вселяется Слово Божие. Поэтому она женского рода. Но носит в себе и рождает она Премудрость Отчую — Бога Слово, который естественно мужского рода.
Примечательно, что в день празднества Рождества Пресвятой Богородицы и Её Успения церковь воздает почитание иконам Софии Премудрости Божией. Святые отцы досинодального периода понимали, что Богородица олицетворяет дух Софии, через которую возводится Храм, приготовляется Трапеза и рождается Агнец — Премудрость Отчая. По этой же причине Дискос со Звездицей, внутри которых помещается Агнец, так же символически обозначают утробу Богородицы и храм Софии.